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    用磷酸化抗體做Western Blot時,要注意哪些?

    發(fā)布時間: 2021-09-15  點(diǎn)擊次數(shù): 1392次

    今天給大家分享一下在用磷酸化抗體做Western Blot時,應(yīng)該注意些什么。


    1.警惕內(nèi)部敵人

    一定要在 lysis buffer 中加入蛋白酶抑制劑,還要加入一定量的磷酸酶抑制劑,因為組織或細(xì)胞裂解時會釋放出大量磷酸化蛋白的死對頭——內(nèi)源性蛋白磷酸酶,催化磷酸化蛋白(R-p)的去磷酸化,導(dǎo)致不同于正常生理狀態(tài)的差異。因此,外源性加入蛋白磷酸酶抑制劑,抑制磷酸化蛋白的去磷酸化,維護(hù)蛋白質(zhì)的磷酸化狀態(tài),否則即使 band 壓出來也會很淺,結(jié)果也不可信。


    2.低溫能讓他們緊緊地?fù)肀Ψ?/p>

    加一抗后最好 4 度過夜,低溫能讓抗體和目的蛋白緊緊地?fù)肀Ψ健槭裁矗恳驗榈鞍卓乖谀ど峡康氖俏锢砦剑邷叵氯菀酌撀洹Dど系目乖撀淞耍Y(jié)合效率會低。4 度也可使一抗重復(fù)使用多次。畢竟磷酸化的抗體都挺貴的。(土豪隨意)磷酸化的蛋白只占總的蛋白量的極少部分,就像聯(lián)誼舞會上讓來賓多相處一會產(chǎn)生 couple 的概率會大很多那樣,過夜可以保證抗體和蛋白有充分的結(jié)合時間。二抗則室溫 1 小時即可。


    3.磷酸化抗體哪家強(qiáng)?

    當(dāng)然是 Cell signaling 公司。他家做的磷酸化抗體不錯,尤其是 MAPKs 磷酸化抗體。最好根據(jù)廠商的 protocol 來操作實驗,這是實驗成功的保證。


    4.他們不宜“喝奶"

    建議用含 5%BSA 的 TBST 稀釋 phospho-p38 等抗體,效果不錯,而不是用常見的含 5%nonfat milk 的 TBST。因為脫脂奶含磷酸化蛋白豐富,是奶中磷元素的來源之一。


    5.如何避免磷化蛋白君和總蛋白君在膜上“打架"?

    研究完某一蛋白的磷酸化情況后一般也要研究一下該蛋白總的表達(dá)量。但兩者的條帶位置一樣,怎么做?可以這樣:壓完磷酸化抗體后,把相同的 membrane 做 strip 后再壓總蛋白抗體,然后再 strip 一次,再壓內(nèi)標(biāo) actin。


    6.聽 marker 的,沒錯

    做磷酸化蛋白 WB 時,除了目標(biāo)蛋白的 band 以外,往往會出現(xiàn)非特異性的 band。磷酸化抗體 不好的話,甚至?xí)撼龇翘禺愋缘?band,而沒有你想要的 band,所以壓片以后,一定要根據(jù) markers 比對一下,你壓出的 band 分子量是否正確。


    7.洗滌也大有學(xué)問

    洗滌對最后的背景影響也較大,millipore 最近的說明書推薦用雙蒸水洗滌,效果很明顯,具體可以這樣:1st and 2nd 抗體之間,DDW 5min X3 次,2nd 抗體后,DDW 5min X3 次,TBST  5min X1 次,DDW rinse 3-4 次。對比 TBST 洗滌的 membrane,效果有一定差距,背景有效降低,即使壓片 30min,背景仍然是可以忽略的。





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